농촌진흥청, 주요 8대 작물 유전체육종 소재 활용기반 공개

2017.05.29 농촌진흥청

글자크기 설정

- 농업생명공학 분야 유전체 정보 공유 누리집으로 제공 -
작물분야 유전체 정보를 육종에서 활용하는 기반을 누리집으로 공개한다.
농촌진흥청(청장 정황근)은 30일부터 주요 8대 작물의 유전체 정보를 연구자들이 활용할 수 있도록 농생물게놈활용연구사업단 누리집으로 제공한다고 밝혔다.
이번에 공개하는 정보 중에서 연구재료 검색란에는 유전체육종이 가능한 오픈소스플랫폼¹⁾ 4종과 유전변이를 확인하기 위한 8대 작물 '벼, 콩, 고추, 토마토, 무, 사과, 배, 포도'의 핵심집단과 콩의 거대유전분석집단의 종자와 유전체 정보 등을 수록했다.
핵심집단²⁾ 범주에는 벼를 포함한 8개 작물들의 42,726자원을 대표하는 2,415자원의 핵심집단의 유전체 정보를 포함한 SNP 700만여 개의 정보가 등재되어 있다.
또한 유전체 효과를 정확하게 측정하기 위한 거대유전분석집단 3,025계통의 종자와 SNP³⁾ (single nucleotide polymorphism, 단일염기다형성) 13만여 개의 정보다 수록됐다.
특히, 유전체 정보자료의 오픈소스플랫폼에서는 콩, 포도, 두과, 가지과 작물의 유전체육종을 지원하기 위한 대량 분자표지⁴⁾ 개발 부분 등이 있어 유전체 육종가가 사용하기 편리하다.
또한 이번에 공개된 유전체 정보 자료에는 고추, 무, 인삼 등 표준유전체⁵⁾ 6종(7작물)과 큰느타리버섯 등 미생물 3종, 시금치 등 전사체 2종을 자료로 제공한다.
더욱이 눈길을 끄는 부분은 연구소, 대학, 종자회사 등의 다양한 분야 연구자들의 연구개발 효율을 높이기 위해 핵심집단과 거대유전분석 집단의 종자와 유전체 정보가 동시에 분양될 수 있는 시스템을 함께 제공한다.
종자와 유전체 정보 분양을 촉진하기 위해 '연구소재(자원) 및 생명정보 분양․정보 공유 지침(17.02.07)'을 제정해 자원과 연계된 생명정보를 필요한 연구자 및 육종가에게 분양될 수 있게 했다.
종자와 유전체 정보의 공유는 새로운 것을 개발하기 위해 공통으로 사용돼야 하는 정보 출처를 공유하는 체제로서 연구의 효율성과 진척속도를 높일 수 있을 것으로 기대된다.
이용방법은 농생물게놈활용연구사업단 누리집(www.tagc.or.kr) '연구재료 정보 공유/활용' 범주 아래에 각 작물별 분양관련 담당자에게 연락하면 된다. 누리집은 인터넷 익스플로러 10 이상과 크롬에서 사용할 수 있다.
농촌진흥청 문중경 농생물게놈활용연구사업단장은 "지난 10여 년간 쌓은 유전체 기반 거대자료를 다양한 분야의 연구자들이 공유하도록 누리집을 만들었다."라며, "진행 중인 차세대바이오그린21 사업의 완수와 더불어 우리 미래 농업의 새로운 분야를 대비하기 위한 초석이 될 것으로 기대한다."라고 말했다.
----------------------------------
1) 새로운 것을 개발하기 위해서 공통으로 사용되어야 하는 소스를 공유하는 체제로서, 작물육종 분야에서는 연구재료, 분자표지, 특성 정보 등을 공유하여 새로운 품종개발을 촉진하는 시스템을 의미
2) 유전체육종을 효율적으로 지원할 수 있는 유전분석 집단 중 하나로서 전체 유전자원의 유전적 다양성을 대표하는 최소 집단
3) SNP(single nucleotide polymorphism, 단일염기다형성) : DNA 염기서열에서 하나의 염기서열(A, T, G, C)의 차이를 보이는 유전적 변화. 개인 또는 개체마다 다른 유전적 특성을 찾아낼 수 있는 분자표지로 개발할 수 있음
4) 표현형으로 나타나는 DNA 단편 또는 염기서열을 알고 있는 DNA 단편
5) 각 생물종의 유전자 분석에서 가장 핵심이 되는 유전자 정보 지도이며, 표준게놈지도라고도 불린다.
[문의] 농촌진흥청 농생물게놈활용연구사업단장 문중경 063-238-4761

“이 자료는 농촌진흥청의 보도자료를 전재하여 제공함을 알려드립니다.”